科学家对发表论文时间越来越长深感不满
时间:2017-12-07

  越来越多的科学家对发表的论文感到不满

  这个过程在他们的生活中花了很长时间,阻碍了申请工作,资助和任期,并且减慢了研究成果的传播。

  资料来源:马特·墨菲

  丹妮尔·弗雷泽(Danielle Fraser)首次提交论文发表时,她完全无法理解即将发生的痛苦经历。

  在过去的三千六百万年里,弗雷泽花了大约18个月的时间研究了整个北美的数千个化石标本。现在她有了一个有趣的结果:在温暖湿润的气候中,动物种群在不同纬度上分布最广。这项对加拿大卡尔顿大学弗雷泽博士学位至关重要的工作,可以用来预测哺乳动物对气候变化的反应,这是当前生态学研究的一个关键问题,因此,她的导师鼓励她在2012年10月在科学上投下了这个成就。

  10天后,论文被拒绝。弗雷泽再次把它交给另一本美国着名的杂志“国家科学院院刊”。结果文件再次被拒绝。接下来,她试图为生态信件投票,但是这篇文章又回来了。当时,我非常失望。这篇文章还没有经过评论,我真的很想知道如何去完善它。

  2013年5月,弗雷泽将这篇论文提交给皇家学会杂志B,这是一个他的领域里的高影响力期刊。在弗雷泽第一次投票给“科学”杂志七个月之后,该杂志发表了文章进行审查。终于成功了!弗雷泽想。但她不知道的是,她只走了漫长而崎岖的出版道路的第一步:三份意见书,两份拒绝,两次大修,时代起草。散文发表后,弗雷泽几乎不想再看一眼。

  弗雷泽的挫败感是分享的:研究人员不断质疑交付成果的时间,许多人表示,他们感到被投诉,拒绝,接受,重新认证和重新评估的周期陷入困境,这个过程花了很长时间他们的生活,阻碍了申请工作,资助和任期,并延缓了研究成果的传播。2012年,纽约洛克菲勒大学的神经科学家莱斯利·沃索尔(Leslie Vosshall)撰写了一篇文章,感叹科学出版的发表缓慢。什么,过去三年都发生了变化,情况恶化了。

  同行评审

  争论的一点是评论者现在要求更多。旧金山加利福尼亚大学的细胞生物学家Ron Vale分析了1984年头6个月在“自然与细胞生物学”杂志上发表的生物学论文,并在2014年的前6个月发表。当这三篇论文期刊进行比较,他发现平均作者人数和研究组数量在实验数据上增加了两到四倍。淡水河谷表示,这表明发表论文所需的数据量有所增加。他怀疑大部分来自试图满足裁判要求的作者的额外数据,科学家们对这些过分热心的批评者感到自满,他们似乎要永远需要更多或不同的实验来揭示一个观点。英国华威大学的细胞生物学家史蒂芬罗伊尔(Stephen Royle)发表的一组文章显示,近四个月的时间用来改善九个月的妊娠期,以便修改论文并再次提交。

  许多科学家也责备杂志编辑。他们认为,当陪审团的意见混杂时,编辑们不愿意为论文的作者提供明确的指导和决定,从而不必要地拖延审查和修改的过程。期刊领导者不同意这种说法,并说他们的编辑非常善于处理陪审团的评论意见,The Cell的主编Emilie Marcus表示,他们的期刊编辑有责任决定如何发表论文,并帮助作者制定一个改变计划。

  马库斯还说,“细胞”杂志正在努力减少同行评审时间,例如增加只经历一轮改变的论文数量。 2015年,The Cell发表的论文中有14%是这样做的。

  “自然”杂志编辑Ritu Dhand表示,自然的编辑也发现审稿人越来越难找到,可能是因为审查的文件太多。

  旧金山加利福尼亚大学计算生物学研究生Daniel Himmelstein发现,PubMed数据库中的论文数量在2000年至2015年间翻了三番多,现在已经接近100万。

  技能提高

  数字出版可能有利于缩短从接收到出版的生产时间,而不是审查时间。在Himmelstein的分析中,自二十一世纪初以来,用于论文制作的时间减少了一半,稳定在二十五天的平均水平上。

  一些新的期刊和在线出版平台承诺进一步加快出版过程。 PeerJ于2013年推出,是现在鼓励开放式同行评审的几种期刊之一。这些期刊的评审人名单和评论全部贴在文章上,希望更大的透明度能够避免审稿人不必要的延误或重大的修改请求。

  生物医学和生命科学期刊eLife于2012年推出,促使编辑在几天内做出初步决定,并迅速回顾论文。给予审稿人严格的指导,不要提出完美的审判,只有在两个月内可以完成额外的分析,才能提出要求。否则,这篇文章将被拒绝。加州大学伯克利分校的细胞生物学家,eLife的主编Randy Schekman认为,这些政策意味着超过三分之二的论文接受的论文经历了一轮评论。

  在2015年的分析中,Himmelstein根据3482种期刊的平均审阅时间创建了一个排名。这些期刊从2014年1月到2015年7月在PubMed数据库中都有时间标记的文章。分析发现Peer J相对较快:审查在提交后的第74天完成。 eLife需要108天,科学公共图书馆大楼需要117天。相比之下,“细胞”审查时间为127天,“自然”为173天,“科学公共图书馆医学”为177天,“发育细胞”在流行的生物医学期刊中是最慢的,历时194天。

  预印重新考虑

  对于生物学家来说,加速出版的一种方法是拥抱预印本。 “物理评论E”副主编,德国马尔堡大学理论物理学家布鲁诺·埃克哈特(Bruno Eckhardt)表示,预印本使研究迅速受到欢迎和批评。提交给bioRxiv纽约冷泉港实验室的服务器预印本在24小时内在线发布,并且拥有一个数字对象标识符(DOI),随后的变更带有时间标签,任何人都可以阅读和评论文章。更重要的是,支持者认为,预印本的出版可以被加入到传统的出版过程中,例如2012年推出的F1000Research,通过发表论文,然后邀请公众同行评审和修改来实现。

  一些科学家走得更远,正在使用各种平台来发表研究中容易得到的每个假设,数据集或图表。每个文件可以给一个DOI,所以可以被引用和跟踪。作为预印本发表论文的Himmelstein使用Thinklab平台编写并发布自2015年1月以来一直在进行的新项目的结果。

  但是,预印和实时数字出版平台并不是万能的。沃索尔说,许多生物学家对预印本感到害怕,因为他们担心他们的结果将被竞争对手抢占,或失去一个想法的信用和知识产权。即使在预印本出版之后,科学家们也会发现自己忙于同行评审和高影响力的期刊,希望最后发表这份文件,以增加他们的简历。沃索尔表示,科学界依靠传统的期刊作为威望的过滤器,把重要的文章留在读者的眼中,没有它们,我们如何找到好的东西?

  对于弗雷泽,她的论文发表近两年后得到了肯定的答复,最终在“科学公共图书馆综合”上发表。文章已被浏览近2000次,下载次数280次。该出版物还帮助她在史密森尼自然历史研究所担任博士后研究员。

  但是,弗雷泽不想再经历整个过程。因此,她目前更倾向于将论文发布到可能立即发布结果的中期期刊上。如果我的最终目标是获得一份教学工作,我不能等两年才能拿到一篇文章。 (宗华)

  中国科学通报(2016-02-25第3版国际)

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  自然报告(英文)