德科学家获五角大楼DNA分析比赛冠军
时间:2017-12-07

  德国科学家获得五角大楼DNA分析锦标赛 - 新闻 - 科学网

  美国国防部赞助的DNA分析挑战比预期的要困难得多,但获胜者已经出现。上周,国防部宣布,胡森团队将因其DNA分析快速计算机程序获得100万美元奖金。今年早些时候,103名选手中只有三名来到决赛,比赛的设计和得分制度受到了一些顶尖选手的严厉批评。

  德国图宾根大学的生物信息学家丹尼尔·胡森(Daniel Huson)进入了决赛,声称他和队友对获胜者有很好的感觉。他们很高兴地发现他们觉得正确。

  防御威胁减少代理(DTRA)算法挑战赛的官方称号试图找到更好的方法来鉴定DNA样本中的组织和基因,以确定可能的生物恐怖威胁。挑战对任何人都是开放的,参与者通过在线比赛主持人Inno Centive提交作品。胡森说,他享受了赢得比赛所需的疯狂,不间断的工作:唯一的这样的工作是当我在Cerrex研究人类基因组时。

  在比赛中,参赛者需要获得九组基因数据的确切分数。一些人对DTRA的模糊评分算法表示不满,并认为他们不得不开发一些程序来满足一些模糊的要求。

  事实证明,这项任务太困难了,DTRA不得不延长期限,放宽需求。在这一点上,与胡森和环境生命科学中心的两名同事生物信息学家谢超和图宾根大学计算机科学专业毕业生本杰明·布赫芬克(Benjamin Buchfink)一起参加了比赛。

  得分方式非常微妙。胡森承认,有些事情让人惊讶。不过,他表示,他的团队能够通过多种不同的方式稳步发展。 (张冬)

  “中国科学”(2013-09-30第3版国际)